İçmesuyu arıtma tesislerinde içilebilir özelliğine kavuşan suyun musluklardan aynı kalitede akmasını temin için gerekli altyapı çalışmalarının yanısıra suyun kalitesini izlemek üzere uluslararası akreditasyona sahip laboratuvarlarda, standartlara uygun analizler yapılarak sürekli denetlenmesi gerekmektedir.
Musluklardan akan suyun kalitesinin izlenmesinin yanında; hamsu kaynaklarındaki su kalitesinin ve sanayi tesislerinin ürettiği atıksuların takibinin yapılması, İstanbul Sahillerinin ve derelerinin su kalitesinin mikrobiyolojik açıdan izlenmesi gerekmektedir.
İçmesuyu, atıksu ve kimya laboratuvarlarını kapsayan GC-MS/MS (Gaz Kromatografi Kütle Spektrometresi), GC (Gaz Kromatografi Cihazı), TOC (Toplam Organik Karbon Cihazı), IC (İyon Kromatografi Cihazı), ICP-MS ve HPLC (Yüksek Performanslı Likit Kromotografi) ,LC-MS-MS gibi ileri teknolojik cihazlar kullanılmakta, bu sayede ağır metallerden toksinlere, mikrobiyolojik analizlerden suyun tadına, kokusuna ve kirletici parametrelere kadar birçok analiz yapılabilmektedir.